Type: Dragon / Flying
Mega Rayquaza is de Mega Evolution van Rayquaza met type Dragon/Flying. Anders dan andere Mega Evolutions heeft deze vorm geen Mega Stone nodig: Rayquaza evolueert wanneer het de move Dragon Ascent kent. De Sky High Pokémon leeft al honderden miljoenen jaren in de ozonlaag en kalmeert Primal Groudon en Kyogre. In Mega-vorm beschikt het over de ability Delta Stream.